1141年に平時輔が滋賀県大津市の日吉大社を勧請したのが始マリと言われています。
飛騨高山の南側地域の氏神として、高山城の鎮守として、祀られていました。
本殿は流造で、拝殿は三方三間寄棟造。
4月に行われる高山祭りの山王祭としても、とても有名です。